フィックスターズ、従来比15倍速のデコンボリューション処理を用いた膨張顕微鏡向け画像処理パッケージ「Expansion Microscopy Studio」を無償で提供

2018 年 11 月 14 日


各位
株式会社フィックスターズ
代表取締役社長 三木 聡
(コード番号: 3687 東証一部)
問合せ先 取締役管理本部長 堀 美奈子
(電話番号:03-6420-0751)

フィックスターズ、従来比 15 倍速のデコンボリューション処理を用いた
膨張顕微鏡向け画像処理パッケージ
「Expansion Microscopy Studio」を無償で提供


マルチコア CPU/GPU/FPGA を用いた高速化技術のグローバルリーダーである株式会社フィックスターズ (本社: 東
京都品川区、代表取締役社長: 三木 聡、以下フィックスターズ) の米国子会社である Fixstars Solutions, Inc. (本社:米
国カリフォルニア州アーバイン) は、11 月 13 日 (米国時間)、エクスパンション顕微鏡(膨張顕微鏡)における画像処
理を高速化するソフトウェアパッケージ「Expansion Microscopy Studio」 (以下 ExM Studio) を無償で提供することを発
表しました。 このソフトウェアは www.exm.studio より入手できます。




ExM によるマウスの脳(海馬) の 3D 画像

従来の光学顕微鏡では可視光の中で最も短い波長の半分程度の約 200nm 以下の物体はぼやけてしまい、脳細胞
など複雑な組織の詳細な観察は出来ませんでした。 エクスパンション顕微鏡法(Expansion microscopy)は観察したい
生体試料を物理的に拡大することにより、光学顕微鏡の分解能を向上させる方法です。 ポリマーを用いて生体試料
を拡大することで、3 次元、かつ、ナノスケールの解像度で複雑な組織を観測することができます[1]。 エクスパンショ
ン顕微鏡法では生体試料を拡大するので、顕微鏡の小さな視野で標本全体をカバーするために何度も画像を撮影し
ます。 生体試料の完全な 3 次元画像を得るためには、多数の高解像度画像ファイルを統合してつなぎ合わせる必要
があります。 これを実現するための適切なアプリケーション/ツールの選択は容易ではありませんでしたし、画像処理
時間は数十時間以上かかることもあります。

「ExM Studio」は、ライフサイエンスの研究者のために多数の画像データを高速に処理するための使いやすいソフトウ
ェア環境を提供します。 ExM Studio の最初のバージョンでは、世界最速のデコンボリューションソフトウェア[2]が用意
されています。 これはエクスパンション顕微鏡だけでなく一般的な蛍光顕微鏡にも有効なツールです。 Fixstars
Solutions, Inc. は、NVIDIA 社製 GPU を利用してデコンボリューションプロセスを高速化し、CPU ベースのオープンソ
ース Deconvolution Lab2 に比べ 832 倍、同じ GPU 環境を使用した商用の Huygens に比べて 15 倍の高速化を達成
しました [2]。
「ExM Studio」 の入手、およびソフトウェアの詳細情報は、www.exm.studio をご覧ください。 今回提供する「ExM
Studio」 は最初のリリースです。 機能を拡充した第 2 版を 2019 年初頭にリリースする予定です。 Fixstars Solutions,
Inc.は、生命科学の研究者が細胞の内面や生物のあらゆる要素を探究することを支援していきます。

参考技術資料:
1. Fei Chen、Paul W. Tillberg、Edward S. Boyden(2015)、 "Expansion microscopy"、Science。347(6221):543-548。
2. Fixstars Solutions, Inc.社内でのベンチマーク結果。 詳細は、www.exm.studio/#performance を参照ください。


フィックスターズについて
フィックスターズは、"Speed up your Business" をコーポレートメッセージとして掲げるテクノロジーカンパニーです。マ
ルチコアプロセッサを効率的に利用するためのソフトウェアの並列化および最適化と、省電力かつ高速 IO を実現する
新メモリ技術を活用したアプリケーションの高速化を通じて、医療、製造、金融、エンターテインメントなど、様々な分野
のお客様のビジネスを加速し、グリーン IT を実現しています。


社名 株式会社フィックスターズ https://www.fixstars.com/jp/
所在地 東京都品川区大崎 1-11-1 ゲートシティ大崎ウエストタワー18 階
設立 2002 年 8 月 8 日
資本金 5 億 5,086 万円 (2018 年 9 月末現在)
代表者 代表取締役社長 三木 聡

報道関係のお問い合わせ
株式会社フィックスターズ マーケティング担当
Email: press@fixstars.com
Tel: 03-6420-0751

5259